自问世以来,在多种难治性疾病的治疗上显示出很大的潜力。但有时CRISPR也会“出错”,如在DNA的其他地方进行切割,即所谓的脱靶效应。研究人员开发出一种识别这些不必要切割的新方法。CRISPR切割时DNA被破坏,细胞将很多不一样的DNA修复因子聚集到基因组中的特定的治疗靶点,以修复断裂并将切割末端连接在一起。如果我们能够找到这些DNA修复因子的位置,就可以确定CRISPR的切割位点。
研究人员根据这一思路探究了一组不同的DNA修复因子。结果发现, MRE11是最先到达DNA切割位点的蛋白质之一。MRE11就像宝藏地图上的指引点,告诉研究人员蛋白质的去处。利用MRE11研究人员开发了DISCOVER-Seq新技术。人类基因组非常庞大,如果打印出所有DNA序列,是一本高达16层楼的书籍。而利用CRISPR对DNA进行切割时,就像试图从书中删除特定页面上的一个特定单词一样,简直是大海捞针。然而,令人惊喜的是,MRE11竟然可以精确删除特定单词的所有字母。
与之前只有在实验室中通过细胞培养的检测脱靶效应不一样,该方法依赖于细胞的自然修复过程来识别切口,所以它侵入性更小且更可靠。值得关注的是,DISCOVER-seq是第一种可以在任何活体组织中直接从CRISPR编辑工具中找到切割位点的方法。这意味着它可以应用于任意查找切割位置,并且可以轻松应用于以前难以使用的不同系统。
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