肺腺癌和肺鳞癌是非小细胞肺癌的两个主要的病理亚型，具有不同的基因表达谱及生物学标志物。肺腺癌主要起源于II型肺泡上皮细胞，而肺鳞癌则来自于基底细胞。另外还有一种特殊的病理亚型，约有4%的非小细胞肺癌在同一个肿瘤中会同时包含腺癌和鳞癌，临床上称之为肺腺鳞癌。肺腺鳞癌中腺癌和鳞癌部分往往具同样的基因突变谱。
肿瘤标志物：鳞状细胞癌抗原（SCC）和细胞角蛋白片段21-1（CYFRA 21-1）在肺鳞癌患者中常有升高，但仅作为参考，不能用于诊断。肺鳞癌的EGFR突变比例比肺腺癌低的多，仅为3-5%。肺腺鳞癌的EGFR突变比例略高，约为8-10%。类似于肺腺癌，EGFR突变的肺鳞癌和肺腺鳞癌更多见于女性和不吸烟患者。第一代EGFR靶向药（厄洛替尼和吉非替尼）治疗EGFR突变肺鳞癌的疗效（一个回顾性研究，n=19人，ORR 26%，PFS 5月）明显弱于EGFR突变肺腺癌，而且几乎没有完全缓解的患者。
第二代EGFR靶向药阿法替尼更适合治疗这一类型的患者。而EGFR突变肺腺鳞癌的疗效接近肺腺癌。今年ESMO年会报道了中国的一个研究，67例EGFR突变肺腺鳞癌患者，第一代EGFR靶向药的中位无进展生存期10.7月，其中15例患者耐药后接受奥希替尼的中位无进展生存期为10.2月。
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