胃肠间质瘤在男女中发病的可能相当，发病高峰年龄在55岁～65岁。肿瘤可发生在消化道的任何部位，但以原发于胃的多见，其次为小肠、食管和结直肠。肿瘤较小时多无症状，极容易疏漏或被误诊。患者常在体检、钡餐、胃镜检查或其他手术时才偶然发现，因此不少患者在首诊时就已伴有转移。除此以外，还有相当一部分患者是由于肿瘤增大出现了某些临床症状才被发现的。例如肿瘤位于食管者可有吞咽困难，位于胃者可有上腹部不适或上消化道出血，位于十二指肠者经常伴有梗阻性黄疸，位于肠道者可有腹痛、腹块、梗阻、便血或穿孔等。
目前治疗胃肠间质瘤的主要方法就是手术，于是很多患者就会问，术后复发的几率高不高，根据数据统计，术后两年一半患者会复发。由于胃肠道间质瘤对常规放化疗均不敏感，完全医治性手术依然是原发性胃肠道间质瘤的治疗方法,然而，即使接受了完全医治性手术，患者仍有很高的复发的可能。首次手术切除肿瘤后，在两年中间有一半的患者会出现胃肠道间质瘤复发的情况，且多数复发肿瘤切除后均会再次复发。
与此同时，除了要重视胃肠间质瘤术后的预防复发治疗外，对于一些体积巨大的胃肠道间质瘤，不能贸然手术，否则很可能会导致肿瘤破裂，肿瘤细胞在腹腔内到处种植、转移。而且手术之后也应该进行巩固治疗，让治疗的效果发挥更大。
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