培美曲塞是肿瘤治疗过程中经常会用到的一种化疗药物，它主要是通过破坏细胞内叶酸依赖症的正常代谢过程，抑制细胞复制，从而抑制肿瘤的生长。培美曲塞的副作用可在各系统均有表现，如血液和淋巴系统、胃肠道系统、肝胆、肾脏、新陈代谢系统、神经毒性、眼睛、皮肤及皮下组织各系统的异常。培美曲塞使用时也会出现副作用，培美曲塞说明书中提到单药使用最常见的不良反应（发病率≥20%）的表现是疲劳、恶心和厌食症。
随机接受培美曲塞和顺铂治疗的患者，发生率在1%和5%之间（包括5%）的临床相关的毒性反应包括：AST，ALT和GGT升高，感染，发热，中性粒细胞减少性发热，肾衰竭，胸痛和荨麻疹；发生率≤1%的临床相关的毒性反应包括心率失常和运动神经元病。随机接受培美曲塞单药治疗的患者，发生率在1%和5%之间包括5%的）临床相关的毒性反应包括：神经障碍，运动神经元病，腹痛，肌酐升高，中性粒细胞减少性发热，无中性粒细胞减少性感染，变态反应/过敏和多型红斑；发生率≤1%的临床相关的毒性反应包括室上性心率失常。
培美曲塞说明书中还包括一些罕见的不良反应，国内文献见相关报道有培美曲塞致迟发荨麻疹性血炎，培美曲塞致肾功能不全、消化道出血，甚至制腹泻、多器官功能衰竭死亡。培美曲塞国外报道的不良反应中除了可预料到的骨髓抑制，伴或不伴发热的感染、腹泻和黏膜炎外，近两年有见个案报道的是培美曲塞引起双下肢浮肿及液体滞留，也曾见报道培美曲塞致肺毒性的案列。
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