肺毒性虽然少见，但会致命，所以对于药物引发的肺毒性有诸多猜测。比如，考虑到其为迟发性，克唑替尼相关肺毒性可能是超敏性肺炎。另外，有研究者称，间质性肺炎（ILD）的发生可能是由于ALK抑制剂介导的抗肿瘤免疫反应，等等。治疗相关肺损伤的管理根据诊断的不同而各异。无论是有肺部症状，还是无症状的影像学表现，在考虑肺毒性之前均需排除感染性肺炎或疾病进展。
根据ESMO指南，如果怀疑患者有药物相关的超敏反应，停药为强制性要求。由于缺乏相应的临床研究，现在糖皮质激素仍为标准治疗。克唑替尼、色瑞替尼、艾乐替尼的说明书上也明确建议需立即停药。布加替尼可以在1-2度肺毒性缓解后重新给药，但是3-4度毒性出现时，也必须强制性停药。研究者搜索了Medline和额外途径（ESMO, ASCO, WCLC的摘要）数据，依照PRISMA和Cochrane指南进行系统评价分析。
结果表明，在4943名接受ALK抑制剂治疗的患者中，共有105名出现肺毒性（2.1%）。其中，克唑替尼的肺毒性发生率为1.8%（49/2706）。布加替尼的肺毒性发生率最高，为7%（25/359）。Ceritinib, Alectinib, Lorlatinib的肺毒性发生率分别为1.1%，2.6%和1.8%。其中，65%的患者肺毒性为3-4度，这些患者的死亡率为9%。27例患者可见肺炎型影像学表现，37例患者考虑有间质性肺部疾病。出现肺毒性的患者中，25%的患者由于肺毒性由于肺毒性永久停药。
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