CAR-T药物的生产成本约占最终售价的10%左右，所以高昂的价格主要来自于相关研发成本的分摊。目前CAR-T药物生产环节的成本主要来自于人工操作的成本。CAR-T生产过程的标准化、自动化以及安全性、无菌性、纯度等质量控制是客观评价缓解率的先决条件。
封闭的自动化设备的引入不仅可以提高安全性，同时也可以有效降低成本。多家CAR-T研发企业已经形成自己的工艺流程，其中具有代表性的是德国美天旎公司的全自动平台CliniMACSProdigy，能够实现病人血液细胞的分选、转染、扩增自动化，避免生产过程中多个设备之间切换造成的人员成本和污染风险。
此外，CAR-T药物的生产成本受失败率的影响也较大。据诺华的临床数据显示，自体CART制备的失败率是10%，因此通用型CAR-T的开发有助于排除个体差异，实现规模化生产，缩短回输时间，从而降低成本和治疗费用。
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