依鲁替尼(伊布替尼)治疗华氏巨球蛋白血症(WM)疗效十分显著，但不可避免的也会带来一些副作用，但是大多数患者不会经历所有副作用。副作用的发作时间、持续时间以及严重程度通常可以预测，且副作用大多具有可复性，并于治疗结束消失。以下是依鲁替尼常见的发生率超过30%的一些副作用：血小板减少或血小板功能改变引发出血并发症、腹泻、中性粒细胞减少、血红蛋白降低、疲劳、肌肉骨骼痛、肿胀、上呼吸道感染、恶心和瘀斑。
以下为不太常见的副作用（发生于大约10-30%的患者中）：高血压、呼吸短促、便秘、皮疹、腹痛、呕吐、食欲减退、咳嗽、发烧、口腔和嘴唇发炎、头晕、尿路感染、肺炎、皮肤感染、身体乏力或无力、肌肉痉挛、鼻窦炎、头痛、脱水、消化不良、瘀点（由毛细血管出血引起的红色或紫色斑点）、关节疼痛和鼻出血。依鲁替尼曾导致心跳异常，例如房颤。若在服用后出现心跳过快或异常、胸痛、头晕等现象，或感觉要晕倒，请立即联系医生。房颤通常会采用依鲁替尼剂量调整、外科手术或非外科手术及支持性药物进行治疗。
依鲁替尼极少发生严重出血的问题。需使用抗凝血药或其他血小板功能抑制药物的患者，使用依鲁替尼可能增加失血风险，如果进行抗凝治疗，应当保持谨慎。获得性血管性血友病为一种出血障碍疾病，可能会在IgM水平高时发生。建议在使用依鲁替尼之前，考虑对有出血病史的WM患者进行血管性血友病活性测试。患者应该与医生讨论出血的风险。依鲁替尼可能增加罹患某些癌症的几率，尤其是皮肤癌。生物素用于控制与依鲁替尼相关的指甲/皮肤/毛发变化，但没有明确的科学证据支持其安全性或有效性。FDA建议患者应告知其医疗服务人员其正在服用含有生物素的任何补充物。服用依鲁替尼的癌症患者不太可能面临一种名为肿瘤溶解综合征(TLS)的严重健康问题。
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