靶向药物治疗是复发转移性胃肠道间质瘤（GIST）的标准治疗，伊马替尼、舒尼替尼和瑞戈非尼分别是一、二、三线药物，靶向药物显著延长了复发转移性GIST病人的生存时间，同时随着靶向药物治疗时间的延长，耐药后出现疾病进展的问题几乎不可避免。越来越多的小样本单中心回顾性研究发现，对于在靶向药物治疗下获得疾病缓解、疾病稳定或局限性进展的复发转移性GIST进行外科干预，有可能有助于改善病人的生存。
复发转移性GIST应在TKI治疗期间每隔 3 个月内进行影像学评估，以判断残余病灶是否转化为可切除病灶，以改良的 Choi 标准或 RECIST1.1 版标准为依据，经过多学科综合治疗协作组（MDT）评估后和充分的医患沟通后谨慎选择手术。手术的总体原则为控制风险，尽可能完成较满意的减瘤手术，尤其是完整切除TKI抵抗病灶，并在不增加风险的前提下尽可能多地切除对TKI治疗有反应的病灶；尽量保留脏器功能，尽可能保证病人术后生活质量，术前充分备血，输尿管逆行置管可减少输尿管损伤机会；术后尽早恢复分子靶向治疗。
手术范围不宜太大或并发症风险过高，否则一旦出现严重的术后并发症（例如漏），病人将无法在术后短期恢复应用靶向治疗，从而可能导致肿瘤快速进展。有条件者均应尽可能多的切除腹腔转移肿瘤。肠系膜和腹膜种植GIST应尽量选择单纯肿瘤切除，避免切除过多的肠管和壁层腹膜；除非所有肿瘤能够完全切除，否则应尽可能避免联合脏器切除。如为二次或多次手术，注意耐心仔细分离粘连，辨认解剖结构。复发转移性 GIST 常较原发局限性 GIST 血供更丰富，特别是耐药肿瘤和位于盆腔的种植肿瘤，沿肿瘤包膜分离，使包膜完整，可减少出血。伊马替尼治疗有效的病灶处理常较容易，而进展病灶包膜常欠完整，特别是盆腔病灶，剥离面渗血较多。
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