ALK阳性肺癌在具体的治疗处理上，可采用配合局部治疗如手术或者放疗的同时继续口服ALK抑制剂，但是病情的监测可能需要加大频次。而对于后一种情况，即所谓的非ALK依赖的患者，目前首选的治疗模式主要就是根据基因检测的结果选择相应的药物。
除此以外，这部分患者也可以考虑直接使用第三代的ALK抑制剂即lornatinib（劳拉替尼），这种情况基本类似于EGFR T790M阴性的患者使用第三代的EGFR抑制剂即osimertinib（奥希替尼），但是需要注意的是其有效率仅30%，而对于第二代ALK抑制剂耐药后如果穿刺再活检检测出ALK位点的话，直接使用lorlatinib的话其有效率也能达到50%以上。
由于第一二三代的抑制剂在对ALK位点的抑制上存在一定的差异，所以也可以根据检测的结果选择对位点更敏感的同类型或者不同类型的抑制剂，这也就是临床上经常被提到的出现耐药后从一种第二代的抑制剂换成另一种抑制剂或者从第三代的药物再重新换成crizotinib治疗。除了考虑分子靶向治疗以外，如果未找到可作用的靶点的话，则也可以考虑使用其它治疗模式比如化疗或者抗肿瘤血管形成治疗如安罗替尼，阿帕替尼等。
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