在输注14天后，在接受抗GD2 CAR-T细胞治疗的小鼠中检测不到DIPG细胞，而对照组小鼠肿瘤细胞并无消减，50天后，小鼠全部被处以安乐死，研究人员用免疫染色法分析了小鼠大脑残存的肿瘤细胞。结果发现：接受抗GD2 CAR-T细胞输注的小鼠仅残存极少数（几十个）癌细胞，而对照组小鼠则是具有数万个癌细胞。并且，研究人员发现实验组小鼠残存的癌细胞不表达GD2，说明这些残存癌细胞对免疫治疗并不敏感，有可能导致癌症的复发。
相关研究表明，在脊髓和丘脑中的胶质瘤也有H3K27M突变，并发现同样表现出高水平的GD2表达，基于此，研究小组在小鼠的相应解剖学位置上植入人脊髓和丘脑胶质瘤细胞，输注抗GD2 CAR-T细胞。结果表明，脊髓处胶质瘤细胞被有效清除，然而丘脑处胶质瘤模型小鼠部分因CAR-T治疗的副作用而死亡，研究人员表示，免疫细胞产生的炎性反应导致了脑水肿，这是非常危险的，因为丘脑处于大脑深部。
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