阿法替尼用于EGFR罕见突变的非小细胞肺癌患者，大多数具有EGFR突变的非小细胞肺癌患者为19号外显子缺失或21号外显子的L858R点突变。然而，却有一小部分EGFR突变的患者(10%)的肿瘤患者有突变却是不常见的突变类型，这类患者被称之为EGFR罕见突变，要命的是，这类突变的患者对于普通的1stTK没有效果。而此时阿法替尼又来补漏了。
这是基于一项综合了LUX-Lung 2，LUX-Lung3以及LUX-Lung 6三项研究的亚组混合分析。研究者分析整合了LL2, LL3以及LL6试验中，所有受试者均为不常见EGFR突变的类型，如Gly719Xaa, Leu861Gln, and Ser768Ile 等。汇总三个临床研究838名患者，共发现100名不常见EGFR罕见突变患者，其中75人接受阿法替尼治疗，25人接受化疗。
阿法替尼对于该类人群具备减小肿瘤大小以及延长无进展生存期的作用，1例发生Gly719Xaa突变的患者获得了CR，另外两例有K739_1744dup6和Leu858Arg+Glu709Gly/Val突变的患者肿瘤缩小100%。阿法替尼对某些亚型，尤其是Gly719Xaa, Leu861Gln, and Ser768Ile 有疗效。对其他突变型活性少。在新发T790M突变的患者及20外显子插入突变的患者临床疗效较低。
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