CAR-T细胞治疗可引起肿瘤溶解综合征(tumorlysissyndrome，TLS)和细胞因子释放综合征(cytokinereleasesyndrome，CRS)等全身系统性损伤，有效监测和及时处理是治疗毒副反应的关键。
肿瘤微环境(tumormicroenvironment,TME)中存在大量免疫抑制细胞、免疫抑制分子以及胞外基质。TME的免疫抑制性主要由免疫抑制细胞介导，如调节性T细胞(Tregs)、髓源性抑制细胞(myeloidderivedsuppressorcells,MDSCs)和M2型巨噬细胞等。这些细胞及其分泌的细胞因子，如转化生长因子-β(TGF-β)和白细胞介素(IL)-10等，在实体肿瘤中严重抑制CAR-T细胞的抗肿瘤作用。
CAR-T细胞脱靶效应限制了CAR-T细胞在实体瘤中发挥作用，且大多数实体瘤缺乏特异的肿瘤抗原且存在肿瘤异质性。CAR-T细胞特异性杀伤表达相应抗原的靶细胞，因此获得理想靶抗原是CAR-T细胞在实体瘤中发挥杀伤作用的前提，理想的靶抗原应仅在肿瘤组织中表达，而在正常组织中不表达或者低表达。由于实体瘤存在抗原异质性，进行CAR-T细胞治疗时，肿瘤细胞会降低或者改变表面抗原的表达，使CAR-T细胞疗法受到限制并伴随脱靶效应。
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