在发现肿瘤细胞中的新抗原之后，这些新抗原或者新抗原表位可以通过不同的平台被呈现出来，包括使用肿瘤细胞提取物，RNA或DNA编码的部分或全部蛋白，或者在树突状细胞中表达的重组病毒或细菌载体。额外添加疫苗佐剂可以进一步增强对TAA的免疫反应。虽然理论上肿瘤疫苗似乎非常有价值，但是在多项临床试验中它们的表现缺差强人意。这让科学家们致力于揭示肿瘤疫苗效力不强的原因。一个需要考虑的重要因素是抗肿瘤疫苗在已经被确诊携带肿瘤的患者中接受检验，而这时候肿瘤的免疫抑制机制已经在发挥作用。
因此，免疫检查点抑制剂的成功给肿瘤疫苗疗法带来了新的希望。免疫检查点抑制剂的临床研究表明体细胞突变负荷和随后具有临床益处的新抗原的出现之间存在正相关关系。这为将免疫检查点抑制剂与激发T细胞的抗癌症疫苗联用提供了理论基础。免疫检查点抑制剂可以提供类似于疫苗佐剂的作用。这种组合有可能为携带“冷”肿瘤的患者提供益处。
开发抗癌症疫苗的挑战是找到作为疫苗的最佳抗原。可供选择的抗原包括过度表达的自身蛋白（例如前列腺特异性抗原），在肿瘤和健康组织中表达量不同的蛋白，和新抗原。新抗原可能是开发抗肿瘤疫苗的理想抗原，因为它们只在肿瘤中存在，而且随着肿瘤的进展不断产生。而它的缺陷在于每个患者的新抗原都不相同，这意味着疫苗也需要个体化定制，延长了疫苗到达患者手中的时间。
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