ALEX研究头对头地比较了第二代ALK-TKI阿来替尼和第一代克唑替尼的疗效和安全性，结果显示，阿来替尼组相比于克唑替尼组，客观缓解率更高，达到82.9%（克唑替尼组为75.5%），且从疗效瀑布图上可以观察到，阿来替尼组有效的患者，肿瘤缓解深度更深。PFS对比也显示出阿来替尼组具有更显著的优势，两组的中位PFS分别为34.8个月和10.9个月。阿来替尼和克唑替尼相比，在疗效上的差异十分显著，最关键的因素可能有以下3点：
阿来替尼通过优化药物结构，增加了对于激酶的选择性，同时IC50值降低到1.9nm，相比第一代克唑替尼的3.0nm，增强了对作用靶点的抑制性，从而提升药物疗效。同时更强的结合性会带来更大的缓解深度，ALEX研究显示，阿来替尼组75%的患者肿瘤缓解深度达50%以上，克唑替尼组则只有50%。
研究表明，第二代药物阿来替尼对于ALK激酶域可能出现的L1196M、G1269A、C1156Y等耐药突变具有显着的抑制效力。在临床研究中，对于激酶域二次突变的前摄性抑制能够有效推迟耐药的出现，在一线治疗中获得更长的疾病有效控制。
脑转移是肺癌高发的转移部位之一。二代药物从结构上避免了药物从脑部被排出，使得脑-血浆药物浓度比率提升。因此，阿来替尼使脑转移患者的PFS大大延长，同时12个月累计脑转移的发生率，对比克唑替尼，从41.4%降低到9.4%,脑转移的发生得到显著降低。
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