根据世界卫卫组织的报告显示，在抗逆转录病毒疗法（ART）三线药物方案的政策上面。南非是作为一线非核苷逆转录酶抑制剂为基础的抗病毒治疗和二线蛋白酶抑制剂（PI）为基础的抗病毒治疗均失败的患者开发了一个国家三线抗治疗项目。由南非的一项实验中的数据显示在对抗一线和二线抗逆转录病毒药物产生耐药性的人，在一线和二线治疗的第一年仍然可以获得较高的病毒抑制率。尽管这其中有高达57%的人显示对蛋白酶存在耐药基因位点，但是使用克力芝或其它药物之后，仍然获得了病毒的抑制。
三线方案在研究中被定义为在记录了基于洛匹那韦（PI）的方案产生耐药或治疗失败后，使用包括达芦那韦（DRV/c），拉替拉韦（raltegravir）和依曲韦林（etravirine）方案的任何一种。这项研究提供了第一个证据，证明在公共卫生的大队列和资源有限的环境中，在第一年使用三线抗逆转录病毒治疗（ART）的有效性。然而，它没有显示出最初一年后人们会发生什么，因此需要做更多的分析来确定方案的有效性。
在南非的研究中，大约有83%和79%的人在6个月后分别达到了1000拷贝以下和400拷贝以下的病毒学抑制。由WITS生殖健康和艾滋病毒研究所的米歇尔·摩尔豪斯博士说，这表明，尽管存在高水平的耐药性，但在资源有限的环境中，三线方案的良好病毒学抑制率是可以实现的。在一线和二线抗病毒治疗方案中，有很高比例的患者产生了耐药，可能是由于一线失败后没有及时转换到二线治疗。其中有144左右的患者当中有97%的患者对克力芝和阿扎那韦有耐药性。
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